中斷：
6502有3個中斷IRQ/BRK、NMI和RESET，每個中斷都有一個16位的向量，即指針，用來存放該中斷發生時中斷服務函數的地址。中斷發生時CPU都會把狀態標志和返回地址壓棧，然后調用中斷服務程序。
IRQ/BRK中斷由一下兩種情況產生：一是軟件通過BRK指令產生，一是硬件通過IRQ引腳產生。
RESET在開機的時候觸發，這是ROM被裝入，6502跳到RESET向量指向的地址沒有寄存器被修改，沒有內存被清空，這些都只在開機是發生。
NMI指不可屏蔽中斷，它在VBlank即屏幕刷新時發生，持續時間根據系統（NTSC/PAL）不同而不同。NTSC是每秒60次，而PAL是每秒50次。6502的中斷延時是7個時鐘周期，也就是說，進入和離開中斷都需要7個時鐘周期。它產生于PPU的每一幀結束，NMI中斷可以由$2000的第7位的1/0控制允許/禁止。
大部分中斷應該使用RTI指令返回，但是有些游戲不用，例如《最終幻想1》。它用一個很奇怪的方式：手工修改堆棧指針，然后執行RTS指令。這種方法在技術上是可行的，但是應該盡量避免。
以上中斷在ROM內有以下對應的地址：

中斷地址	中斷	優先權
$FFFA	NMI	中
$FFFC	RESET	高
$FFFE	IRQ/BRK	低

NMI 非屏蔽中斷

IRQ/BRK　屏蔽中斷

RESET 開機中斷