對許多串行標準來說，嵌入式時鐘恢復是示波器眼圖分析的基礎，它還為時鐘到數據恢復(CDR如圖3所示)等測量提供支持。處理嵌入式時鐘信號的設計人員除了要考察主要指標外，還要考慮示波器可以通過哪些方式使時鐘恢復得更快、更簡便、更靈活、可重復性更高。

應用需求一直引導著選擇方向。示波器能否用于檢修或一致性測量?有哪些時鐘恢復機制?示波器能不能實時恢復時鐘，顯示動態眼圖特點?

大多數高端示波器都提供了兩種時鐘恢復中的一種方法，即基于軟件的時鐘恢復或基于硬件的時鐘恢復。軟件時鐘恢復從存儲的采集數據中生成。對采用TDSRT-Eye自動化一致性測試和分析軟件等程序的一致性測試，軟件方法是公認的首選工具。

可以使用基于鎖相環(PLL)的時鐘恢復，進行實時眼圖采集，但這里也需要認真推敲指標：PLL(可以是軟件恢復或硬件恢復)能不能適應當前串行標準中演變的時鐘頻率?有些能，有些不能，因此必須了解其間的差異。

眼圖測量是設計人員需要使用示波器進行的某些最復雜的程序，另一個實例是抖動測量。在這兩種情況下，設計人員都可以從示波器上運行的應用軟件的專業經驗中受益。軟件工具最大限度地減少了學習時間，明顯降低了設置、測量和分析時間，如圖3所示。但是，這些工具從沒有出現在主要指標清單內。工程師必須自己下功夫，透過主要指標，保證提供適當的工具。